Flowcytometri (FCM).
Flowcytometri er en hurtig, objektiv og kvantitativ metode til analyse og
separation af celler i suspension. Princippet er ganske enkelt. De celler eller
partikler, der ønskes analyseret, bringes i suspension som enkelt-partikler og
føres i en væskestrøm én for én forbi en lysstråle (typisk en 488 nm laser),
hvorved der fra hver enkelt partikel udsendes pulser af spredt lys og
fluorescens. Hvis et fluorescerende farvestof er bundet specifikt og
proportionalt til en bestemt komponent i en celle, f.eks. ved immunokemisk
farvning, vil den målte fluorescenspuls repræsentere mængden af den pågældende
komponent i denne celle. Resultatet udtrykkes i et histogram som den relative
fordeling af den pågældende komponent inden for den målte population af celler.
Med flowcytometri er det muligt simultant at måle en
række forskellige egenskaber for hver enkelt celle (multiparameter analyse).
Celleprøven kan være farvet med flere antistoffer mod flere forskellige
antigener, og således at hvert antistof kan skelnes på en bestemt
fluorescensfarve (FITC, phycoerythrin m.fl.) . Idet værdierne af hver parameter
for hver enkelt målt celle bliver lagret i en computer (list mode), er det
muligt at undersøge forskellige markørers indbyrdes fordeling imellem cellerne
i den målte population. Sammenhængen mellem flere parametre undersøges ved, at
man først definerer en subpopulation ud fra et sæt af kendte parametre (gates,
bitmaps) og derefter bruger disse kvantitative selektionskriterier til
sortering (gating, back-gating) af det elektronisk lagrede datasæt for at opnå
den ønskede grafiske og statistiske information om den pågældende
subpopulations ukendte fordeling i andre parametre.
Cellulær heterogenitet kan på denne måde beskrives
kvantitativt, og subpopulationer med bestemte sæt af egenskaber kan
diskrimineres. Multiparameter flowcytometri giver derfor gode muligheder for at
beskrive de komplicerede forhold mellem cellers aktivering, proliferation,
differentiering, modning og endelige opløsning, der findes i heterogene
cellepopulationer som f.eks. i blod og knoglemarv med deres forskellige
differentieringslinier eller i kræftsvulster med abnorme subkloner i blanding
med normale celletyper. Ulemper ved flowcytometrisk undersøgelse er f.eks., at
det er vanskeligt at præparere solide væv til suspensioner af intakte
enkeltceller, at vævstopografien går tabt, og at det i et almindeligt
flowcytometer ikke er muligt efter måling at genfinde hver enkelt celle med
henblik på yderligere undersøgelser.
Flowsortering (fluorescensaktiveret
cellesortering, FACS). En flowsorter er et specielt bygget flowcytometer, hvori
individuelle celler kan adskilles fysisk fra resten af cellepopulationen.
Ethvert sæt af kriterier, som kan defineres i relation til den flowcytometriske
analyse, kan benyttes til at udløse sorteringsbegivenheden for den individuelle
celle eller partikel. Ingen anden metode end flowsortering kan separere levende
celler ud fra deres kvantitative expression af bestemte molekyler eller ud fra
en forud fastlagt kvantitativ kombination af egenskaber. På dette grundlag kan
flowsortering benyttes som del af en analytisk strategi. Især til præparative
formål kan det være fordelagtigt at kombinere flowsorting (serielle
begivenheder) med en masseseparationsmetode (parallelle begivenheder). I visse
tilfælde kan den samlede sorteringsproces effektiviseres afgørende med en
forudgående immunomagnetisk separation.
Imagecytometri. For vævsanalyse er kvantitativ
imagecytometri, baseret på scanning af stationære præparater, en vigtig modpart
til flowcytometri. Ved imagecytometri kan de individuelle celler genfindes og
undersøges igen efter fornyet farvning, således kan man f.eks. korrelere
parametre for den levende celle med parametre, der kun kan måles efter
fiksering eller permeabilisering. Til sortering af celler fra vævsstrukturer er
lasermikrodissektion en vigtig modpart til flowsortering.
DNA-flowcytometri.
Flowcytometrisk DNA-analyse har talrige anvendelser inden for biologisk og
medicinsk forskning, diagnose og terapi, føde- og miljøkontrol, m.v.
Flowcytometri er kendt som en hurtig, objektiv og kvantitativ metode til måling
af celler eller andre partikler i suspension, baseret på et ganske enkelt
princip, men cellepræparationen og dataanalysen kan være kompliceret og tidsrøvende.
Mange typer af biologiske partikler kan analyseres for DNA-indhold, således
både eukaryote og prokaryote celler, cellekerner, kromosomer, vira og
DNA-fragmenter (detektionsgrænse 5-100 kB). Der findes en række forskellige
procedurer for analyse af DNA-ploidi, cellecyklus, DNA-syntese, cytogenetiske
aberrationer, mikrobiel artsbestemmelse, m.v. Ved DNA-analyse af tumorvæv til
påvisning af DNA-aneuploide subkloner (detektionsgrænse for DNA-forskel er 2-3
%) forudsættes justering af flowcytometeret til højest mulig præcision (CV 1-2
%) samt brug af interne standarder. I fortolkningen af resultaterne må man være
opmærksom på betydningen af vævsheterogenitet og begrænsninger i
DNA-farvningens specificitet og støkiometri. DNA-fluorokromerne har forskellige
egenskaber med hensyn til excitations- og emissionsspektrum,
fluorescensintensitet, AT/CG specificitet, bindingstype (kovalent eller
interkalerende), kromatinstrukturafhængighed, membranpermeabilitet evt. efflux
og uspecifik binding til RNA. Hoechst 33342 og DRAQ5 kan benyttes til
vitalfarvning. DNA-farvning kan også udføres indirekte ved FISH-teknik. I visse
henseender kan støkiometriske afvigelser være nyttige. Kombination af specifik
AT- og CG-farvning kan benyttes ved flowcytometrisk kromosomanalyse. DNA-fluorescensintensiteten
ændres, hvis thymidin substitueres med bromodeoxyuridin (BrdU) i
DNA-syntetiserende celler, hvilket udnyttes til analyse af celleproliferation.
I en multivariat analyse kan DNA kombineres med én eller flere andre parametre,
heriblandt immunokemiske markører for celleproliferation (BrdU),
celledifferentiering, celleaktivering, cellefunktioner og celledød. Sættet af
markører og fluorokromer skal passe til flowcytometrets optiske konfiguration
(f.eks. FITC/PI og FITC/PE/DRAQ5). Med flowcytometrisk bead-array analyse, hvor
signalet bygges op ved hybridisering til specifikke oligonukleotid prober på et
panel af størrelses- og fluorescenskodede syntetiske partikler, kan man
undersøge indholdet i en væskeprøve af et stort antal forskellige
nukleotidsekvenser (mutationsanalyse, SNP).
Sidst
revideret 27. september 2002 /JKL